lunes, 18 de junio de 2018

Semana 14

Por M en C Rafael Govea Villaseñor
Versión 3.21
Última modificación: 3/11/2014




Las células son sistemas abiertos que intercambian masa y energía con su entorno. Los sistemas abiertos en estado estacionario tienen la propiedad intrínseca de alejarse del equilibrio termodinámico desplazando hacia su periferia al desorden (entropía) que se genera en cada proceso que ocurre en su interior.



Las células a lo largo de su evolución han adquirido la información que les permite aumentar su orden interno a costa de desordenar su medio. La Vida es la expresión de dicha información que se almacena y se transfiere de unas moléculas a otras.

La información genética se almacena a largo plazo en el Ácido Desoxirribonucleico (ADN) y consiste en las instrucciones para construir las macromoléculas que participan en casi todos los procesos celulares, los diversos tipos de ARN y las Proteínas.




La secuencia de pares de bases del ADN almacena también la información de cuándo, cuánto, dónde y en respuesta a qué circunstancias del entorno se deben producir las decenas de miles de especies diferentes de proteínas que cada célula requiere para vivir.



Las proteínas se asocian por complementaridad de superficies determinando los procesos celulares. Formando complejas redes de interacciones que terminan construyendo a los organismos y su fenotipo.

Vean por ejemplo el primer mapa de interacciones entre las proteínas humanas (http://www.mdc-berlin.de/en/news/2008/20080910-erwin_schr_dinger_prize_2008_goes_to_resea/).

Cada punto es una proteína y cada línea es una asociación. El estudio encontró 3200 asociaciones entre 1700 proteínas, sólo una pequeña fracción de las proteínas humanas:



El fluir normal de la información sigue el siguiente esquema:




El ADN almacena información usando 4 "letras químicas" que son las bases nitogenadas G (guanina), A (adenina), C (citosina) y T (timina) de sus nucleótidos.  El ADN es una doble hélice hecha de pares de bases de nucleótidos A=T y G=C que unen sendas cadenas de nucleótidos mediante enlaces fosfodiéster:





El ADN tiene dos cadenas complementarias de nucleótidos que son moldes recíprocos: La cadena sentido en dirección 5' ---> 3' y la cadena antisentido en dirección opuesta 3' ---> 5'.




La síntesis de una cadena de ADN requiere una cadena molde y los 4 nucleótidos activados, es decir en forma de: dGTP, dATP, dCTP y dTTP. La adición de cada nucléotido sólo ocurre en el extremo 3' de cada cadena.





Toda célula procede de otra célula progenitora y recibe de ella su información genética. Así pues, antes de cada división celular ocurre la Replicación del ADN. Las dos cadenas del ADN se separan y sirven de molde para rehacer las cadenas complementarias:

La G empareja a la C, la A a la T y viceversa:



                                                 5'TATgCgTAAAgCTTC3'
                                                 __________3'TTCgAAg5'

                                     --->
5'TATgCgTAAAgCTTC3'
3'ATACgCATTTCgAAg5'
                                    --->
                                                5'TATgC3'____________
                                                3'ATACgCATTTCgAAg5'



Así se forman dos moléculas idénticas a la original aunque cada una de ellas tiene una cadena vieja y otra nueva (replicación es semiconservativa). De ese modo cada célula hija tendrá la información para fabricar las macromoléculas necesarias para funcionar.

Cuando la célula requiere de una proteína o de un ARN funcional, entonces copia el gen correspondiente, pero usando un "alfabeto" distinto. En vez de GACT del ADN usa GACU del ARN. 

El proceso se llama transcripción del ADN porque se escribe la misma información, pero usando un conjunto de "signos" un poco distinto. En vez de T se usa U.





Como puedes ver en la imagen de arriba, la cadena antisentido es el molde para elaborar el ARN que crece por su extremo 3'. 

Copia a un procesador de textos la siguiente molécula de ADN y debajo de la cadena antisentido escribe la secuencia de ribonucleótidos de unidos durante la transcripción del ADN. Luego envíame tu ejercicio a mi correo electrónico. 

Escribo 4 nucleótidos de ejemplo y el símbolo de la guanina con "ge minúscula" para no confundir con la C de la citosina.

Muestro la cadena sentido en naranja, la cadena antisentido en verde y el ARN en azul.

5'TATgCgTAAAgCTTCgCTACgATCCgTAgCUCgACCATCgA3'
3'ATACgCATTTCgAAgCgATgCTAggCATCGAgCTggTAGCT5'
5'UAUg...


En las células, muchas de las moléculas de ARN fabricadas son de ARNr que se ensamblan con decenas de proteínas para constituir los ribosomas (las "máquinas" que fabrican proteínas) catalizando la formación del enlace peptídico, otras son de ARNt (de transferencia) cuya función es transportar cada uno de los 20 tipos de aminoácidos proteícos al ribosoma y leer las instrucciones del ARNm.

Las moléculas ARN mencionadas antes se llaman no codificantes (nc) porque no dirigen la síntesis de proteínas como el ARNm (m = mensajero. Recientemente se han descubierto muchas moléculas de ARNnc distintas que participan en la regulación de distintas fases del flujo de información y también en la defensa antiviral de las células.

La mayoría de las moléculas de ARN parecen pertenecer a la clase codificante, el ARNm. Estos, son una especie de "planos" de las proteínas que contienen el nombre (o codón) de cada uno de los aminoácidos que deben de ser unidos para fabricar los miles de proteínas que requiere una célula para funcionar.




En el ARNm se encuentra codificada la secuencia de aminoácidos que debe unir el ribosoma como una serie de tripletes de nucleótidos llamados codones. Hay 64 codones posibles y sólo 20 aminoácidos proteicos. Así que hay codones sinónimos para casi todos los aminoácidos. 

Por ejemplo: el codón GGG = glicina, GGU = glicina y UUU = fenilalanina o UUC = fenilalanina. 


El esquema que contiene todos los codones y su equivalencia se llama código genético que es prácticamente Universal. En el esquema se especifican en círculos concéntricos la primera "letra": G, A, C o U; la segunda: G, A, C o U, la tercera "letra" de cada codón (también G, A, C o U) y el aminoácido que codifica. 

En el esquema circular mostrado abajo, los codones se muestran radialmente desde el centro hacia afuera. Los aminoácidos se escriben con su  símbolo de 3 letras. Los colores muestran el tipo de aminoácido:





Por ejemplo:



Ahora, traduce el pequeño trozo de ARN que simula ser un ARNm. Cópialo al procesador. Usa el código genético. Busca el codón de inicio y a partir de ese triplete coloca el símbolo de tres letras del aminoácido correspondiente. Precisamente como se muestra en la figura de arriba. Luego envía el ejercicio junto con el anterior a mi correo.


5'UAACGAUgUUAgCggUgAUgUggCUAUggggCUAUUAAG3'
Proteína:


Ahora, vean los videos siguientes. Fíjense en las imágenes. No importa si no entienden inglés:


Enrollamiento del ADN en carretes de histonas y en los demás niveles hasta formar un cromosoma condensado de la mitosis. La segunda parte se refiere a la replicación del ADN.



Replicación: ADN --> 2ADN





Transcripción: ADN ---> ARN


Este otro video con subtítulos sobre transcripción:


Un tercer video sobre transcripción:



Traducción: ARNm -----> Proteína






Otro video sobre la traducción o síntesis de proteína:

domingo, 27 de mayo de 2018

domingo, 22 de abril de 2018

Semana 11

Reproducción sexual:

Chicos:

Versión: 3.0
2018-04-23

La genética se estudiaba en Biología 2, pero con los enormes recortes de contenido hechas por instrucciones de la SEP vamos a estudiar parte estos tópicos en biología 1 como continuación de los procesos de división celular y el funcionamiento de los organelos.

Para poder entender las leyes fundamentales de la genética requerimos mencionar la reproducción sexual. Aún no conocemos el programa de biología 2 del "Nuevo Modelo Educativo" (sic) e ignoramos si contendrá lo relativo a la reproducción, así que nos arriesgaremos a duplicarlo para poder explicar la herencia.


La singamia es el evento central de la reproducción sexual y de la herencia.



Estudien las siguientes diapositivas, bajen la presentación a sus móviles:



Estudien también esta otra.




CG2; un poco de rock.


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lunes, 16 de abril de 2018

Semana 10

Metabolismo

Versión 2.3
Última modificación el 2018/04/08

Chicos:

En esta semana estudiaremos unos conceptos básicos sobre el metabolismo celular toda una red de series ordenadas de reacciones químicas.

Preparen los conceptos más importantes. Hagan una lista en su CET (hoja 17), realizaremos un Mapa Mental. Evaluaremos el porcentaje de conceptos relevantes identificados de su lista.

Estudien las siguientes diapositivas:


Para ésta presentación grabé un MP3 para ayudarles a entender mejor. Bajen el archivo y oíganlo, pasen las diapositivas conforme avanza el audio:




Les recuerdo que deben de bajar a sus móviles las diapositivas para su estudio sin consumir datos.




c

viernes, 13 de abril de 2018

Semana 9

Transporte pasivo por difusión simple-


Chicos:
Versión 2.2
Última modificación: 2018-04-13

En esta semana estudiaremos unos conceptos básicos sobre el metabolismo celular y los procesos de transporte a través de membrana que permiten la entrada y salida de sustancias necesarias para la nutrición, respiración y excreción.

Preparen los conceptos más importantes. Hagan una lista en su CET (hoja 16), realizaremos un Mapa Mental. Evaluaremos el porcentaje de conceptos relevantes identificados de su lista.

Estudien las siguientes diapositivas:





También revisen la siguiente página, contiene videos muy útiles para reforzar el tema y esta presentación:

Para ésta presentación grabé un MP3 para ayudarles a entender mejor. Bajen el archivo y oíganlo, pasen las diapositivas conforme avanza el audio:





Les recuerdo que deben de bajar a sus móviles las diapositivas para su estudio sin consumir datos.




c

lunes, 2 de abril de 2018

Semana 8

Acuarela hecha a escala por David Goodsell del citosol eucariótico entre el REL y el A de Golgi. Véase una vesícula en formación y otra yendo hacia el Golgi. La forma de las proteínas, tamaño y su número es real.

Modelo Celular Eucariótico

Chicos:
Versión 2.11
última actualización: 2018-04-06

Para esta semana deben de estudiar la estructura de las células eucarióticas. Pueden visitar la página del enlace anterior. Noten que hay enlaces de hipertexto anidados

También pueden estudiar las diapositivas de la siguiente presentación:








Células que recubren el interior de la Traquea de ratón (muy similar a la nuestra)
Las células en esta fotografía del tejido epitelial se muestran en falso color, Microscopio NanoFab Zeiss, X10000 *

* Este sitio contiene excepcionales fotos de células. 

lunes, 12 de marzo de 2018

Semana 7

Hola chicos:

Con esta entrada del blog comenzamos el segundo tercio del curso de Biología 1.

Vamos a estudiar a la unidad anatómica, fisiológica y de origen de la Vida, la CÉLULA.




Piquen en el enlace para una descripción de las células procariónticas:

Modelo celular Procariótico

También estudien las siguientes diapositivas. Les recuerdo que deben de capturar todas las imágenes o bajar la presentación desde SlideShare.









Nos vemos en clase.
Flagelo de bacteria gram negativa


sábado, 3 de marzo de 2018

Semana 6

Estructura terciaria de la proteína fluorescente Dronpa de 257 aminoácidos


Chicos:
Versión 3.0
Última modificación 2018-03-03

Ahora deben de revisar la siguiente presentación que trata sobre las macromoléculas. Noten que son ellas las que construyen nuestras estructura, nos hacen funcionar y la información que heredamos a nuestros descendientes lo hacemos en ese formato. 




Si no carga la versión incrustada, piquen en el enlace de hipertexto situado en el título de la presentación. No olviden clipear las diapositivas o la presentación.







Vean también, en los siguientes enlaces, la estructura de varias proteínas. No olviden regresar con la flecha de retorno del lado superior izquierdo de su navegador:

Noten las láminas beta y su única hélice alfa de la Vil-Xilanasa

Comparen con la Citocromo C-oxidasa que posee sólo una lámina beta y muchas hélices alfa.


Elaboren un Mapa conceptual de la Composición Macromolecular. Usen el concepto principal Ser Vivo. Fecha de entrega: primera clase de la semana 6, Hoja 15 de sus CET.

Espero sus dudas y aportaciones clickeando en el enlace "comentario", escribiéndolo ahí, clickeando la "vista previa" y luego el botón de "subir comentario".


CG2. Finalmente un poco de humor:

lunes, 26 de febrero de 2018

Semana 5

Chicos:

Versión 3.0
Última modificación 2018-03-03

Continúen estudiando la composición química de los seres vivos en las presentaciones que siguen. Las pequeñas moléculas son muy importantes, participan en el metabolismo (conjunto de reacciones químicas que gestionan la masa y energía celulares).



Noten que hay un audio explicatorio. Piquen en los enlaces. No olviden bajar las diapos a su móvil.



La presentación de diapositivas anterior tiene un audio explicatorio en Internet archive. Piquen en el enlace, arranquen el audio y vayan pasando las diapositivas de a cuerdo a mi voz.





Esta otra presentación de diapositivas, también tiene un audio explicatorio en Internet archive. Piquen en el enlace, arranquen el audio y vayan pasando las diapositivas de a cuerdo a mi voz.




CG2


martes, 20 de febrero de 2018

Semana 4

Resumen de la composición química de un organismo



Chicos:

Versión 1.2 20-02-2018

Para contestar la pregunta ¿De qué estamos hechos los seres vivos? Estudien las siguientes presentaciones. No olviden capturar o clipear las diapositivas.


  • Composición Elemental
  • Composición Molecular
    • PMI
    • PMO
    • Macromoleculas


Esta presentación tiene un audio explicatorio. Arranquen primero el audio y síganlo, avanzando las diapositivas de acuerdo a mi voz. Piquen aquí para ir al sitio del audio.





c

martes, 13 de febrero de 2018

Semana 3

¿Cuál nivel de organización falta en la imagen?



Chicos:
Versión 2.0

Para apoyarlos en su aprendizaje y desarrollo de competencias deben entrar a las siguientes páginas. Además de leer comprensivamente su Material Instruccional (lo marcado como semana 1 y 2 que corresponde a nuestra semana 3 del blog). El objetivo es caracterizar a lo vivo y de mostrarles los niveles de organización de la Materia.

El resultado de aprendizaje que deben obtener es saber extraer el significado de una palabra a partir de la misma palabra y conocer de manera ordenada los niveles de organización (por supuesto de memoria inteligente). Para ello vean primero la presentación de diapositivas.

No está de más insistir que de la misma manera que una computadora, por más moderna y veloz que sea, es inútil si tiene el disco duro vacío, Ustedes requieren llenar su "disco duro con software". 

Usen memoria inteligente. Ya que la memoria bruta es útil, pero de uso más laborioso (requiere más trabajo) y difícil.

 Sean flojos, sólo trabajen lo necesario para cubrir sus objetivos.






Piquen en los enlaces de hiper-texto . Sugiero que lo hagan en orden:

El objetivo es que sepan de memoria (inteligente por supuesto) los 4 aspectos y los niveles de organización. En la tercera semana realizaremos una actividad sobre este tópico. Lleguen a clase con los contenidos de la semana 1 y 2 del material instruccional leídos y aprendidos. 

CG2. Amplien su apreciación musical:




miércoles, 7 de febrero de 2018

Semana 2, La Biología como ciencia.

Chicos:
Versión 2.0
Última actualización: 29/01/2018.

Para apoyarlos en su aprendizaje y desarrollo de competencias deben estudiar las siguientes presentaciones de diapositivas y páginas. La primera les presenta a la Biología y sus ramas. (recuerden que deben de bajar las diapos a sus celulares, ya sea como capturas de pantalla o como clip desde el repositorio en SlideShare)

No está de más insistir que de la misma manera que una computadora, por más moderna y veloz que sea, es inútil si tiene el disco duro vacío, Ustedes requieren llenar su "disco duro con software y datos". 

Usen memoria inteligente. Ya que la memoria bruta es útil, pero de uso más laborioso (requiere más trabajo) y difícil.

 Sean flojos, sólo trabajen lo necesario para cubrir sus objetivos.

Estudien las diapositivas siguientes:






Para bajar las diapos a su computadora, tableta o celular, piquen en el enlace de hipertexto con el nombre de la presentación y obtengan el clip de cada diapositiva desde SlideShare.net (para ello deben de registrarse). CG4e

También pueden visitar la página.
El objetivo es que puedan distinguir entre los 4 tipos de ramas de la biología, sus ciencias básicas y disciplinas que requieren de los conocimientos biológicos. 
Lleguen a clase con los contenidos de la semana 2  leídos y aprendidos. 

Buen aprendizaje. CG2

lunes, 5 de febrero de 2018

Bienvenida al semestre 2018A


Célula dividiéndose por mitosis.
Versión 3.0
Hola Chicos:

A partir del 6 de febrero trabajaremos durante 18 semanas para lograr los objetivos de Biología 1. Descubrir algunos aspectos de la realidad ocultos a nuestros ojos porque pertenecen al Mundo nano y microscópico (nano- = milmillonésimo, micro- = millonésimo) de las células como sus componentes químicos, estructura y funcionamiento.

Este semestre estrenaremos nuevos programas que incluyen dinámicas de equipos para reforzar las habilidades socio-emocionales (HSE).

Es muy probable que este semestre no podamos usar los salones de  los edificios D y E. De allí que también sólo sea posible impartir una clase presencial a la semana. De allí que tengamos actividades de aprendizaje a través de Internet. Traten de conseguir acceso a una conexión a Internet el día que les toque no asistir al Colegio, de preferencia en una computadora.

La primera actividad es copiar el encuadre del curso a su cuaderno de evidencias de trabajo (CET).


De la sesión 1 a la 2:
  • Bajar la app Socrative Student a su teléfono.
  • Entrar a socrative.com como estudiante, anotar el salón (room)  221746,  identificarse anotando su grupo-matrícula y contestar la encuesta. Por ejemplo: Para mi nombre sería 481-972384G  Abro la encuesta a las 21 horas del primer día de clases hasta las 12 horas del día siguiente.
  • Llevar a la segunda clase el CET con la Carátula bien hecha seguida del encuadre.
  • Bajar la aplicación EdModo a su teléfono e inscribirse a su grupo usando la contraseña que les daré en la primer clase. No olviden colocar un buen retrato en su perfil y seguir las indicaciones.
De la sesión 2 a la 3:
  • Entrar al room 221746,  identificarse anotando su grupo-matrícula y contestar la evaluación diagnóstica según el horario comentado en clase.
CG2a. Descubran la realidad aunque sea invisible a sus ojos. pintura de Alan Ayers 

Encuadre

Las normas que seguiremos este semestre 2018A son las siguientes:


1.Valor del curso 100 puntos.
 

2.Puntos para aprobar el curso: 60 ó más puntos.
 

3.Tolerancia para entrar al salón = 10  minutos.
 

4.Se puede entrar sin hacer ruido después de los 10 minutos,  pero el  retardo se obtendrá eventualmente al contestar una pregunta sobre el  tema en estudio diciendo su primer apellido inmediatamente después de responder.

5. El grupo (en todas las clases) deberá mantener acomodadas las mesas en 5 filas dejando un pasillo en la parte posterior del salón.

6.Una vez iniciada la clase no hay permisos  para ir al baño.


7. Antes de hacer nada, deben de limpiar sus manos con gel.

8. Durante la clase No se permite el uso de  teléfonos celulares, lentes  oscuros, audífonos, ni aparatos MP3. Excepto cuando así se les indique.
 

9.Número máximo de  faltas tolerables 20% = 7.
 

10.Tener >7 faltas implica calificación de  W. Recomiendo enfáticamente que sigan asistiendo a clase, aún cuando ya tengan calificación de W. Si así lo hacen será más fácil pasar el examen de recuperación.
 

11.Faltar a una clase no libera de la responsabilidad de cumplir con las tareas extra-clase requeridas para la siguiente sesión.
 

12.No se dan permisos para “matar clase”. Por que ello es una falta grave de ética de trabajo. Si el grupo "mata clase" las actividades de ese día se considerarán como vistas.

13. Con el objeto de poder entregar tareas, poder acceder al blog de Biología 1 (biol1c201.blogspot.com) e identificarlos adecuadamente: Todos los alumnos deberán inscribirse a su grupo de EdModo, subir a su perfil un buen retrato reciente (sólo su rostro) como avatar y seguir las instrucciones. 


14.Los días feriados  oficiales son los únicos en los que no habrá clases. La asistencia se tomará en  cuenta para evaluar la “actitud” del alumno y tomar decisiones sobre su calificación final.  El  son feriados  oficiales el 19 de marzo, 1°, 10 y 15 de mayo. Las vacaciones son del 10 al 21 de abril. El fin del semestre es el 30 de junio. Las jornadas académicas y de gestión serán los días 27/febrero, 25/abril y 31/mayo.

15.Total de puntos asignados a actividades de labora­torio: 30. Eventualmente, éstos puntos podrán asignarse por proyecto.
 

16.Si la sesión de laboratorio se suspende por fuerza mayor entonces los puntos de dichas sesiones se asignaran por un trabajo adicional  (investigación documental o realización de modelos).
 

17.Para obtener los puntos asignados a las prácticas de laboratorio se requiere cumplir con todo lo siguiente,  excepto en las actividades llevadas a cabo extra-clase. (En ellas se requiere reporte por equipo):

a)Asistir a la sesión de laboratorio. Es condición obligatoria traer resuelta la actividad previa del instructivo. Si no realizaron la actividad previa perderán la mitad del puntaje de la sesión de laboratorio.
b)Traer leído el manual de laboratorio.
c)Portar la bata de laboratorio
d)Traer por equipo el material solicitado en el manual.
e)Traer por equipo un  trapo y una barra pequeña de jabón.

18.Los exámenes se harán vía Internet cada semana. Para ello consigan un teléfono inteligente y tiempo de navegación para las dos clases de la semana. No se les pide que compren, sino que desarrollen sus competencias para llegar a clase equipados (pidan prestado los aparatos a sus familiares y amigos).
 

19.Duración máxima de c/ examen = 20  minutos.
 

20. La calificación anotada en el SiiAA será el promedio de los últimos exámenes del bloque correspondiente.

21.Puntos asignados por exámenes: 50. 

22.Puntos asignados por desempeño en clase: 20 puntos.
23.Calificación final asignada por la suma de puntos ganados en  exámenes parciales, evaluaciones semanales y laboratorio. Estos porcentajes serán válidos Si y sólo si, la calificación de los exámenes es aprobatoria. Si se reprueban los parciales es posible aprobar, pero no seguro, todo dependerá del desempeño y de otras actividades.
 

24.Cada alumno requiere traer todos los días a clase:
  • Material instruccional
  • Alcohol en gel
  • Lápices de colores,
  • Lápiz,
  • Goma,
  • Regla,
  • Cinta adhesiva
  • Cuaderno profesional cuadrícula chica (Cuaderno de Evidencias de Trabajo) con hojas numeradas en el lado superior derecho.
  • 3 resaltado­res (amarillo, naranja o rosa y verde o azul),
  • calculadora  científica y
  • Teléfono inteligente capaz de navegar. El teléfono debe estar en modo silencioso y guardado a menos que reciban la instrucción de usarlo para las evaluaciones y otros fines.
25. Este encuadre debe copiarse a la 2ª hoja de la porción de su cuaderno dedicada a la asignatura, después de su caratula con los datos de identificación pertinentes. Sean prolijos. Se verificará en la segunda clase y servirá para la evaluación de la primera semana.

26. Deben pegar en la hoja 3 la fotocopia la credencial para votar de alguno de sus padres (ambas caras) o tutores con la firma de enterado del contenido del encuadre y que conocen mi cuenta de correo para consultas sobre su desempeño.



Bacterias intestinales al microscopio electrónico de Barrido, falso color.

Finalmente una pieza de música (CG2):